En la parte que comprende del Már de Cortés (258,593 km2), se estima que hay más de 700 especies de peces
La Reserva se ubica en la Costa Norte de Nayarit y tiene una superficie de 133,854 ha que incluye una gran red de lagunas costeras salobre, bosques de mangle, pantano, deltas y marismas. Esta área representa entre el 15% y el 20% del total de manglares que existen en el país.
Resguarda ecosistemas típicos de la costa de Nayarit y abarca los municipios de Acaponeta, Rosamorada, Santiago Ixcuintla, Tecuala y Tuxpan.
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En este lugar se mezclan aguas saladas y dulces, formando cuerpos lagunares costeros que son el refugio para cerca de 100,000 aves acuáticas de 446 especies, de las cuales el 40% son nacionales.
Dentro de la vegetación hay selva baja caducifolia, palmar y manglar dentro de la que se destacan el mangle rojo, el mangle negro, el mangle botoncillo y el mangle blanco.